四十三年后，巴布尔几经征战，攻陷了继孔雀王朝后相隔两千年再次统一印度，建立了莫卧儿帝国。到巴布尔的孙子阿克巴三代人统治时期，莫卧儿帝国版图北起中亚，南达德干高原，东西都达到海滨，几乎囊括整个南亚次大陆以及阿富汗等地，是印度史上空前强盛的时期。
阿克巴乃莫卧儿帝国第三代君主，1556年，胡马雍去世后，阿克巴继承皇位，并开始在巴布尔奠定的基础上建立一个庞大的帝国。阿克巴是一个复杂的人。他坚强勇敢，富有胆识，这些特点使他备受那些统治印度社会的军事首领们的爱戴。他还拥有出色的领导能力，这使人对他忠心耿耿。他非常聪慧，尊重知识。
在其统治后期，他的宫廷成为各类知识分子的聚集地。虽然阿克巴热爱学习，极其重视书本，但非常令人奇怪的是，他自己却是一个文盲，这在世界统治者中是独一无二的。然而，他搜集了很多藏书，并且成为一个伟大的艺术赞助人。1605年他去世时，阿克巴的成功已为他赢得“大莫卧儿”的称号。
现在的皇帝是查罕杰，1605年登位，己当了十九年的皇帝。
现在的莫卧儿王朝，正是上升期，基本的完成了对印度的统一，这统一是印度土地之上，继孔雀王朝之后的第二次统一，对印度人来说，可惜的是由***完成，而不是佛教徒。
查罕杰是一位残暴荒淫的皇帝，喜欢喝酒，但他也很有文化素养，是一位有名的艺术赞助人，特别是对绘画大力资助，查罕杰对统治臣民没有多少自己的思想，他继续执行他父亲的基本政策，包括扩张帝国领土。他于1614年征服了梅瓦尔要塞，于1620年征服了坎格拉，于1616年攻占了德干地区的艾哈迈德讷格尔王国一半的领土。
查罕杰统治期间，莫卧儿帝国的弱点还没有明显显现出来。查罕杰巩固了他对印度北部的控制，并从南方的艾哈迈德讷格尔王国那里夺得了领土。总体上来说，他是在和平年代实行统治的，并且与他的父亲一样，他也提倡宗教共存。或许是遵从他的拉其普特母亲的传统，他也庆祝印度教的重大节日。
查罕杰也鼓励艺术家进行试验，于是产生了莫卧儿风格的绘画。与总体上的莫卧儿文化相似，这种绘画融合了不同传统，包括印度绘画的自然主义和欧洲绘画的明暗技法。莫卧儿绘画是美术中一种伟大的传统画派，为后世树立了典范，印度绘画都沿袭这一风格。
但是在两年前，波斯占领了边境城市他们坎大哈，此后查罕杰再未从这场打击中恢复过来，随后，他的儿子沙.贾汗发动了叛乱，更加让查罕杰焦烂额。
这也他印度号称强大，却是无力干涉南洋军，坐山观两虎相斗，却是无力从中取利，因为北方的波斯和儿子的叛乱，牵涉了他太多太多的精力，让他坐失良机，当他勉强的镇压住了儿子的叛乱，形势开始好转，但是他己失去良机，南洋军完成了对果阿的控制。
而且南洋军蕃理院的次官周巡也来了，出任西部军区总督，这也是南洋军众多地方之中唯一的拥有总督的军区，其用意十分明显。
莫卧儿王朝比葡萄牙人进入的时间还晚上十五年，可以说葡萄牙人才是先行者，但是自从莫卧儿一统印度次大陆之后，他们一直有一种伟大的便命感，要赶走外国人，一统印度。
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